Ұлы Тосқауыл Рифінің микробиомасы картаға түсірілді: зерттеушілер 500-ден астам бактерия түрін тапты. Бұл туралы Qazaqyia.kz порталы The Guardian басылымына сілтеме жасап хабарлайды.

Адам микробиомасы толық картаға түсірілгеннен кейін он жылдан астам уақыт өткен соң, ғалымдар Ұлы Тосқауыл Рифін құрайтын микроорганизмдердің кең қауымдастығын анықтады.

48 рифтен алынған теңіз суы үлгілерінің ДНҚ-сын талдай отырып, зерттеушілер Ұлы Тосқауыл Рифінің микробиомасын картаға түсіріп, 360 000-нан астам түрлі вирусты және ғылымға бұрын белгісіз болған 500-ден астам жаңа бактерия түрін құжаттады.

Nature журналында жарияланған зерттеуді Квинсленд университеті мен Австралия теңіз ғылымдары институтының (AIMS) ғалымдары жүргізді.

AIMS-тің аға ғылыми қызметкері, мақаланың аға авторы доктор Юн Кит Йео микроорганизмдерді «риф экожүйесінің өте маңызды бөлігі» деп сипаттап, олар теңіз азық-түлік тізбегінің негізін құрайтынын айтты.

«Рифтегі көптеген микроорганизмдер фотосинтездей алады... өсімдіктер сияқты, олар жарық энергиясын алып, көмірқышқыл газын оттегіге айналдыра алады», - деді ол.

«Оларды криль және басқа зоопланктондар жейді, содан кейін оларды басқа жануарлар тұтынады».

«Біз олардың көпшілігін зерттей алмадық, тек зертханада Петри табақшаларында өсіре алатын бірнешеуін ғана зерттедік».

Бірақ соңғы технологиялық жетістіктер ғалымдарға қоршаған ортадан алынған ДНҚ-ны секвенирлеуге мүмкіндік беріп, бұл микроскопиялық қауымдастықтардың толық бейнесін көрсетті.

Метагеномика деп аталатын бұл сала бір уақытта мыңдаған басқатырғыштарды шешуге ұқсайды; теңіз суының бір тамшысында мыңдаған әртүрлі микроорганизмдердің ДНҚ-сы болуы мүмкін.

«Біз мұны, айталық, 10 жыл бұрын жасай алмас едік, бірақ бақытымызға орай, есептеу қуаты экспоненциалды түрде артып келеді», - деді Квинсленд университетінің микробиологы, мақаланың аға авторы профессор Филип Хугенхольц.

Бес жылдан астам уақыт бұрын басталған зерттеу 808 585 вирустық геномды анықтады, олар зерттеушілердің бағалауынша 362 802 түрлі вирусқа жатады.

Талдау сонымен қатар 876 түрлі түрді білдіретін 5 283 бактериялық және архей геномын анықтады, оның 584-і бұрын ешқашан құжатталмаған.

Хугенхольц бұл үлкен сандар күтілгенін айтты. «Бұл микробтық әлемнің қаншалықты үлкен екенін көрсетеді», - деді ол. «Біз секвенирлейтін барлық жерде... әрқашан жаңа вирустар пайда болады».

«Мен 500-ден астам жаңа бактерия түрін тапқаныма аздап таң қалдым».

«Адам ішегі мен теңіз экожүйесі, менің ойымша, планетадағы ең көп секвенирленген екі экожүйе».

Хугенхольц бұл түрлердің Ұлы Тосқауыл Рифіне ғана тән бе, әлде басқа риф экожүйелерінде әлі ашылмаған ба деген сұрақ туындайтынын қосты.

Зерттеушілер картаға түсірілген микробиоманы риф мониторингінің құралы ретінде пайдалануға болады деп санайды. «Енді біз оны сау риф жүйесін не құрайтынын зерттеу үшін пайдалана аламыз», - деді Йео. «Содан кейін біз бұл микроорганизмдердің, айталық, климаттың өзгеруіне, жылу стрессіне, ағартуға, адам әрекетіне немесе басқа экологиялық бұзылуларға байланысты өзгерістерге қалай жауап беретінін зерттей аламыз».

«Микробтық қауымдастықтар сізге көп нәрсе айта алады. Көбінесе рифте көрінетін өзгерістерден бұрын микроб популяциясындағы өзгерістерді көресіз».

Белгілі бір теңіз аймағындағы микроорганизмдер, мысалы, қорғалатын аймақта балық аулау болғанын көрсете алады. Олар сондай-ақ ауыр металдармен ластану болғанын көрсете алады.

«Ауыр металдардың көрсеткіштерін алу өте қымбат - микробтық қауымдастықтарға әсер ететін өзгерістерді алу арзанырақ», - деді Хугенхольц.

Зерттеушілер ұзын оқылымды секвенирлеу технологиясын қолданды, бұл ДНҚ-ның үлкен тізбектерін кішігірім фрагменттерге бөлуді қажет етпей, бір уақытта оқуға мүмкіндік береді.

Хугенхольц мұны үлкенірек бөліктері бар басқатырғыштарды шешумен салыстырады, «бұл сізге сол басқатырғыштарды оңайырақ құрастыруға мүмкіндік береді».